期刊简介

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  • 杂志名称:上海预防医学杂志
  • 主管单位:上海市卫生局
  • 主办单位:上海市预防医学会
  • 国际刊号:1004-9231
  • 国内刊号:31-1635/R
  • 出版周期:月刊
期刊荣誉:首届《CAJ-CD规范》执行优秀期刊期刊收录:维普收录(中), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 万方收录(中), CA 化学文摘(美), 上海图书馆馆藏
上海预防医学杂志2014年第09期

用于脉冲场凝胶电泳指纹图谱分析的分区条带计数法的建立

陈洪友;屠丽红;陈敏;宋元君;张曦

关键词:分子分型, 指纹图谱, 脉冲场凝胶电泳
摘要:[目的]建立操作简便、软件依赖性低、结果易于交流的脉冲场凝胶电泳( PFGE)指纹图谱分析新方法。[方法]按PulseNet标准操作规程,对44株副溶血性弧菌进行PFGE分型试验,分别利用分区条带计数法和BioN-umerics软件对图谱进行分析,并以型别数、成簇数和Simpson’ s多样性指数( DI)对2种分析方法进行比较。[结果]分区条带计数法可将44株菌分为32个型(DI=97.6%),能发现5簇。 BioNumerics 聚类分析可分为29个BN型(DI=95.5%),能发现4簇。在发现菌株成簇的能力上,2种分析方法的差异无统计学意义。[结论]条带计数法能大大减少肉眼观察的图谱数量,具有操作简便、成本低、对软件依赖性小、结果显示简单直接的特点,能直观反映菌株条带的分布特征,因此应能满足分型信息共享与交流的要求。